山东海事职业学院五年制大专部是从事中职教育的教学管理部门。五年制大专部依托学院办学资源，办学机制灵活，办学理念先进，教学质量优良系部坚持以学生为本，注重培养学生的竞争意识、综合技能、动手能力。

五年制大专部现开设船舶驾驶、轮机管理、机电技术应用、焊接技术应用、船舶电气技术、港口机械运行与维护、港口与航运管理、国际航运业务管理、会计、物流服务与管理及旅游服务与管理等11个中职专业，具有良好的师资水平以及完善的教学设备。目前中职在校生700余人，2015年招生500余人。五年制大专部骨干专业为船舶驾驶专业、轮机管理专业、港口与航运管理专业。其中船舶驾驶专业被评为潍坊市的特色专业。

五年制大专部师资力量雄厚，专任教师共计39人，其中研究生学历共计22人，占教师总数的58%。双师型教师共计9人，占教师总数的23%。强大的师资队伍保证了五年制大专部教学质量的提高和精品课程的创建。